Роден во Комо, Италија во 1702 година со благородно раѓање. Во Шпанија, каде пристигнува бегајќи од војната во Австрија, тој добива широки овластувања за собирање пензија на потомците на Моктезума во Кралскиот Кајас во Мексико.
Тој патувал за Нова Шпанија во 1736 година. За време на осумте години од неговиот престој, тој се посветил на истражување на привидите на Богородица од Гвадалупе, собирајќи значителен графички и пиктографски материјал. Тоа го промовира крунисувањето на имиџот на Гвадалупан, што предизвикува недоверба кон заменичките власти. Тој е заробен и неговата колекција е одземена. Месеци подоцна, откако бил депортиран во Шпанија, се качил на брод што паднал во рацете на пиратите кои го напуштиле во Гибралтар.
Со одлични дела пристигна во Шпанија и стапи во контакт со колекционерот Маријано Фернандез де Екеверија Вејтија кој ја оствари својата ослободителна пресуда назначен за кралски хроничар на Индија, позиција што Ботурини ја отфрли да се посвети на пишувањето за историјата на домородните народи. Иако никогаш не ја обнови својата колекција, тој го напиша Каталогот на Индискиот музеј. Неговото дело е многу оригинално и добро документирано. Починал во Мадрид на неизвесен датум, помеѓу 1750 и 1755 година.
